Stacja towarowa Żižkov rozpoczęła regularną działalność 1 marca 1936 roku i stanowiła pierwszy etap realizacji „Schematów przyszłych modyfikacji kolei w Pradze” (a także ostatni etap, który został zrealizowany), opracowanego w 1927 roku przez głównego inżyniera kolei państwowych, Miroslava Chlumeckiego (1878–1957). Projekt oparty był na północnoamerykańskim stylu stacji wielopoziomowych, towarzyszących im wielopiętrowych budynków, w szczególności typach konstrukcji z żelbetu z płaskimi stropami wspartymi na kolumnach grzybowych, takich jak Terminal Towarowy Soo Line w Chicago (1914) czy Stacja Towarowa Kolei Pensylwanii w Filadelfii (1917). Dominujący kierunek transportu towarowego w Pradze wyznaczył rozmiary dwóch równoległych magazynów i stacji towarowych: północny był krótszym, trzypowłokowym budynkiem z jednym poziomem podziemnym, który służył torom wyjazdowym, natomiast południowy był dłuższym, czteropowłokowym budynkiem z dwoma poziomami podziemnymi, obsługującym tory przyjazdowe. Jednak Chlumecki udało się pionowo rozdzielić operatorów dwukierunkowego ruchu, stosując metodę trójwymiarowych schematów trasowania, którą sam opracował: przeznaczył pochyłe parterowe piętro z platformami dla operacji kolei państwowej, podczas gdy prywatnym firmom dzierżawiącym teren przydzielono platformę wyspową, która była połączona za pomocą dziesięciu stalowych wież dźwigowych i mostów z dwoma piętrami magazynów, a przez windy z poziomami podziemnymi, które były następnie połączone tunelami poprzecznymi z drogą wzdłuż południowej krawędzi terenu. Architekci Karel Caivas (1897–1961) i Vladimír Weiss (1897–1989) byli jednak tymi, którzy nadali tej unikalnej koncepcji operacyjnej formę fizyczną w dokładnie opracowanym kompleksie, który doskonale spełniał ideę budynku jako maszyny.