Ważność budowy linii kolejowej między Budapesztem a Miskolcem była dyskutowana już w latach 30. XIX wieku, jednak kolej dotarła do Miskolca dopiero z dużym opóźnieniem i objazdem – z kierunku Debreczyna – w 1859 roku.
Koncesję na budowę linii kolejowej Szolnok-Debrecen otrzymała firma kolejowa Tiszavidéki Vasút (TVV) w 1856 roku. Budowa postępowała szybko na równinnym terenie, a 121-kilometrowy odcinek został otwarty dla ruchu 25 listopada 1857 roku. Z Debreczyna Tiszavidéki Vasút poszerzyła sieć na północ, osiągając Miskolc w 1859 roku przez Nyíregyháza i Szerencs.
Budowę linii Debrecen-Miskolc znacznie utrudniały nieporozumienia między radą miejską a firmą kolejową w sprawie lokalizacji stacji kolejowej. Napięte stosunki charakteryzowały się tym, że Miskolc, w przeciwieństwie do innych miast, nie wspierał budowy stacji ani darmowymi gruntami, ani materiałami budowlanymi. Inauguracja stacji kolejowej „Miskolcz” miała miejsce 24 maja 1859 roku, bez uroczystej ceremonii otwarcia.
W 1860 roku zbudowano linię kolejową łączącą Miskolc z Kassą (obecnie Koszyce na Słowacji). Rok później, w 1870 roku, otwarto linię Hatvan-Miskolc, która znacznie skróciła długość trasy Budapeszt-Miskolc w porównaniu do trasy Budapeszt-Debrecen-Nyíregyháza-Szerencs-Miskolc, zarówno pod względem czasu (3,5 godziny zamiast 12), jak i długości torów (183 km zamiast 356 km).
W 1880 roku Tiszavidéki Vasút zostały znacjonalizowane i włączone do Węgierskich Kolei Państwowych (MÁV). W 1901 roku przeprowadzono rekonstrukcję stacji kolejowej według planów MÁV. Ferenc Pfaff, główny architekt MÁV, którego nazwisko związane jest z projektowaniem i rekonstrukcją niemal 40 stacji kolejowych na Węgrzech w tym czasie, zaprojektował nowy budynek stacji w stylu eklektycznym, angielskim romantyzmie. Ściany dwupiętrowego budynku wykończono cegłą, a otwory okienne, gzymsy i niektóre elementy fasady pomalowano na biało. Po obu stronach wejścia do hali pasażerskiej znajdują się imponujące wieże.
Do lat 40. XX wieku Miskolc stało się dużym węzłem kolejowym, a stacja Tiszai, tory ładunkowe i ich okolice ucierpiały w wyniku jednej z największych nalotów bombowych II wojny światowej na węgierskie węzły kolejowe 2 czerwca 1944 roku. Sto bombowców strategicznych zrzuciło około 200 ton bomb w trzech falach. 420 osób zostało rannych, a 206 zabitych. Budynki stacji Tiszai zostały uszkodzone, a budynki torów ładunkowych zostały zniszczone.
W czasie komunizmu budynek stacji ulegał pogorszeniu, a podczas remontów i napraw nie spełniono wymagań ochrony zabytków. Jednak w 2003 roku budynek stacji został odrestaurowany do swojego pierwotnego wyglądu z 1901 roku i jednocześnie zmodernizowany, aby odpowiadał wymaganiom współczesności. Trzy daty na fasadzie budynku odnoszą się do założenia stacji (1859), ukończenia budowy budynku zaprojektowanego przez Ferenca Pfaffa (1901) oraz ostatniego remontu (2003).
